三协组成一个镇，每镇的总编制人数为人；
营以下则是增加哨的编制，每营下辖三哨，每哨400人，哨以下管辖三个汛和直辖的三个队，汛以下的编制不变，每汛仍为100人，辖三队，每队32人。
军事级别增加了，将领和军官的等级自然也得增加，经过张鹿安对原本大明将官体系进行微调，每镇的正职为总兵，副职为副将；每协的正职为参将，副职为新增加的偏将；每营的正职为游击，副职为新增加的裨将；每哨的正职为千总，副职为副千户；每汛的正职为把总，副职为百户或者试百户；每队有一名队长（又称总旗官）和一名副队长（新增加副总旗的称呼）；什长又称为小旗官。
具体编制是极为复杂的，以第七协为例，将原亲民官宋德宜撤回，原下辖第七骑兵营调回登州，原来的第三十营游击马天因从孔有德手中获取莫高刀的功劳，晋升为协偏将，成为参将丁维岳的副手，他所空出来的第三十步兵营游击由立功的马德继任。
如果详细述说整编经过会显得特别繁琐，因为涉及到大量的将领和军官的调动，需要同时兼顾“掺沙子”和“埋钉子”，还得照顾新投诚的一些将领的心情，之后先期整编的部队还得与一线的部队进行换防，将一线部队撤下进行重新整编，再派回前线。
整个过程复杂多变，持续了三个月的时间，整编完成后，除了辽南和济州岛的军队外，蓼军的编制简要陈述为：
一、张鹿安直管的近卫镇野战军，包含丘无极统领的近卫协（加强协）、仇有光率领的骑兵第一协（整编后暂时包含六个骑兵营，分别为巴勒的第二骑兵营、周桂轩的第三骑兵营、程万里的第六骑兵营、彭心见的第七骑兵营、贺国勇的第九骑兵营和亚柱的第十骑兵营）、谭应华率领的炮兵协（编制不变）、裴守政的第八步兵协（偏将王驰，下辖马瑞恒的第三十一步兵营、刘桐湘的第三十二步兵营和杨之华的第三十三步兵营）、赵良栋的第九步兵协（偏将为李德，下辖陈利军的第三十四步兵营、来长林的第三十五步兵营和接替了升职的李德职位的降将杜应金所统帅第三十六步兵营）和仇有亮的第十一协（偏将叶晟，下辖杨邦泽的第四十六步兵营、鲁胤昌的第四十七步兵营和骆宾的第四十八步兵营），总兵力合计两万五千余人（近卫镇比较特殊，属于加强军镇）。
二、一线的防守部队为莱州镇和胶州镇，其中莱州镇的总兵为于七，亲民官宋德宸，副将于六，参军董樵，下辖第四协、第五协和新组建的第十五协；
第四协参将曹良臣，偏将曹天助，下辖张状猷的第十三步兵营、孟大石的第十四步兵营和贾得虎的第十五步兵营；
第五协参将为李应详，偏将杨彩，下辖姚来贺的第十六步兵营、李文昇（原杨衍部将，接替李应详原来的位置）的第十七步兵营和秦尚行的第十八步兵营；
第十五协参将为谢迁，副将赵束乡，下辖高三洲（金州降将，接替阵亡的赵慎宽的职位）的第十九步兵营、杨珍（接替阵亡的葛东方的职位）的第二十步兵营和丁可泽（接替调职的程功的职位）的第四十九步兵营。
胶州镇的总兵为张应举，亲民官王朝，副将张勇，参军楚国用，下辖第十二、第十三和第十四协；
其中第十二协参将杨斌，偏将程功，下辖杨鸿升的第二十九步兵营、马德（接替调职的马天的职位）的第三十步兵营和汪思诚的第四十步兵营；
第十三协参将杨御华，偏将为杨衍，下辖孙成功（接替调职的贾明时的职位）的第四十一步兵营、毛邦贵（接替调岗的覃远的职位）的第四十二步兵营和钱鼎新的第四十三步兵营。
第十四协参将为杨三吾，偏将为杨嗣云，下辖宋世尧的第四十四步兵营、秦显率领的第四十五步兵营和陈忠国的第五十步兵营。
三、二线防守机动部队则有受王公弼直管的丁维岳的第七协（偏将马天，下辖张尧中的第二十六步兵营、周魁轩的第二十七步兵营和杨云山的第二十八步兵营）、游击金百里率领的独立第四骑兵营和游击赵不同率领的独立第五骑兵营，驻地为莱阳；
受陈利芸直辖的部队则有覃远率领的第十协（偏将为贾明时，下辖丁岐凤率领的第三十七步兵营、吴成蝰率领的第三十八步兵营和富近仁率领的第三十九步兵营）、游击李二猛率领的独立骑兵第八营（裨将为郭茂才）和游击马国勇率领的独立第十一骑兵营（裨将为巴特尔）。
如果再加上登莱的都司营（省级地方武装）、四个府的守备营（府级地方武装）和各县民团，即使没有近卫镇，只要不是清军倾尽主力而来，登莱一地绝对具备一定的防守之力。
（本章完）
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